W obszarze chronionym znajduje się ponad 20 chronionych terenów - rezerwatów przyrody, znalezisk i obszarów edukacyjnych. Chronione są przede wszystkim tereny występowania rzadkich roślin, rozległe torfowiska oraz pierwotne drzewostany bukowe.

Godny uwagi jest również ogólny charakter Gór Izerskich, który przypomina przyrodę północy.